不论是男性还是女性，一旦发生性功能障碍，不但对于性生活的和谐造成影响，有的甚至对此产生负担，严重影响夫妻感情，甚至导致夫妻关系恶化，因此大家应该科学的认识性功能障碍，了解它的发生原因，以便及时改善这种情况，那么性功能障碍是由什么原因引起呢?
心理因素
由于恐惧性生活的失败而引起的性忧虑，这可能是阳萎或性冷淡产生的常见原因，而对方对性能力的不适当要求或过分要求也可能是性障碍的基本原因;此外，产生性功能障碍的另一个重要因素就是充当旁观者，即在性生活过程中，某一方焦虑又强迫性的注意性伴侣的反应，这种旁观角色会使经历分散，妨碍适度性反应的建立和性高潮的到达。
疾病因素
很多慢性疾病，如糖尿病，高血压，心脏病，肾病等，均可引起暂时性的性欲低下。
某些药物，如激素类药物，降压药，镇静类药物等也可以引起性欲低下。
慢性酒精中毒，体质虚弱，睾丸内分泌不足也会引起性欲低下或性功能障碍问题。
男性生理性性功能障碍
男性外生殖器先天畸形，包茎，龟头或包皮炎症，尿道炎，阴茎炎，脊髓肿瘤，附睾炎，前列腺炎，脑血管意外等，都可能反射性的影响脊髓中枢，导致性功能失调，引起早泄，阳萎或其他性功能障碍症状。
女性处女膜发育异常
处女膜的问题一般婚后第一次接触即可发现，常见的异常有：先天性处女膜闭锁，这种情况根本部可能进行性生活;处女膜环肥厚，情况不太严重不会影响性生活;筛状及纵膈处女膜，轻者或处女膜松弛者，都不会影响性生活。
女性阴道发育异常
阴道闭锁，有完全性与不完全性之分，不完全性阴道闭锁不太会影响性生活;
阴道纵膈：有完全性与不完全性之分，完全性纵膈有时一侧阴道较松弛，可性交无困难，患者可到妊娠后或分娩前才发现;不完全纵膈可不影响性生活，只是有时配偶感到不适。
阴道横膈：如横膈有一小孔，不影响经血外流，如横膈位置较高或较松弛，则不影响性生活，直到妊娠后或分娩前方可发现。
女性外阴疾病
外阴湿疹，外阴创伤，如外阴擦伤或血肿，外阴溃疡，阴蒂或小阴唇粘连，如由于炎症或创伤所引起，外阴干皱，萎缩性硬化性苔藓，巴氏腺囊肿。
