一、合伙合同纠纷案输了会怎么样？
需要按照判决书进行履行义务责任，如果不履行，胜诉一方可以向法院申请强制执行。执行工作由执行员进行。采取强制执行措施时，执行员应当出示证件。执行完毕后，应当将执行情况制作笔录，由在场的有关人员签名或者盖章。
合伙是两个以上的公民按照协议，各自提供资金、实物、技术等，合伙经营、共同劳动的经济组织形式。共同承担风险是合伙法律关系成立的必要条件，是合伙法律关系区别于借款等法律关系的关键要素。
二、合伙协议纠纷案件怎么处理
1、合伙人之间权利、义务关系明确，各合伙人承担债务的份额容易确定，合伙人之间争议不大的，在审理个人合伙对外债务案件时，可以一并确定合伙各方应承担债务的份额，但在裁判文书中应明确各合伙人之间承担的是连带责任;如合伙人之间对如何分担债务争议较大，将合伙组织对外债务与合伙内部债务纠纷一并处理不利于案件及时审理的，可以分开审理。
2、偿还合伙债务超过了自己应当承担数额的合伙人或者部分合伙人对外承租了全部合伙债务后，在向其他未承担合伙债务的合伙人行使追偿权时，其他合伙人均应列为诉讼当事人。
3、对合伙经营期间帐目的核实，应坚持“谁主张，谁举证”的原则，由提出主张的一方当事人举证，在受理案件前尽可能要求当事人清算。在诉讼中核实合伙帐目，可采取以下方式：
(1)、在审判人员的主持下，由各方当事人对所提供帐目单据逐一审核。
(2)、法院将当事人提供的帐目单据委托审计部门进行审核。
(3)、当事人自行委托审计机关对帐目进行审核。
法院对当事人自己或者审计机关对帐目的审核结果应进行审查。当事人对审核结果无异议的，可予认定;对审核结果虽有异议，但又提不出相反证据的，对其异议不予支持。
综合上面所说的，合同纠纷案件是由法院来进行审理判决，如果此纠纷案件输了那么就需要按照法院给予的判决结果履行自己的义务，这样才能保障到各自的权益，所以，对于案件的处理都是有法律依据的，只要双方协商不好就可以走法律的程序解决。
