有关、自治区、直辖市、计划单列市商务主管部门支持和配合中央储备肉管理工作，择优推荐中央储备肉代储企业、储存库、活畜储备基地场和加工企业。储备商品管理中心受商务部委托负责中央储备肉入库、在库、出库的日常管理和具体操作。
一、分类管理
国家储备肉是流动管理的，既包括活猪，也包括冻鲜肉。
国家对储备活猪的生产基地要求是非常严格的，政府会对这些基地给予补贴，1万头储备猪的财政拨款达30万元，因此一旦政府要调用储备肉，基地就必须提供出额定的数量来。
如果全部采用活猪投放市场操作起来困难很大，因为基地里的活猪体重满60公斤的数目很可能不足额，这时就要以冻鲜猪肉来代替。所以，除了活猪储备，还设有一些中央储备肉冷库。
在中央储备肉冷库-18℃的环境下，存放的猪肉保质期是6个月，不过储备冻肉并不是冻了6个月的肉，而是在进货和销售过程中不停更换的流动的冻鲜肉，现在在各大超市里买到的猪肉都是这种冻鲜肉。
二、生产管理
承担国家储备肉加工的生产厂，要有与生产规模配套的活猪接收、检疫检验和待宰设施；设有病畜隔离圈和急宰间及其相应的设施；屠宰车间要分清洁、半清洁和非清洁区，具有完善的给排水条件，生产工艺不得交叉迂回；活猪自麻电、放血到白条肉成品的全部屠宰加工时间不得超过45分钟。
加工分割冻猪瘦肉的生产厂，要设有专门的符合国家标准的分割车间。
预冷间面积、冷风机配备和吊轨布置应满足班生产白条肉的预冷要求。结冻能力应当满足屠宰产品结冻要求；预冷间温度为0℃－5℃，墙、门应采取保温隔热措施，结冻间库温应为－25℃—－23℃。
三、储存管理
国家储备肉必须实行专库储存、专人管理，在储备肉专库外均须挂“国家储备肉定点库”标牌（长50cm，宽30cm）。同时做到责任到人，职责明确，制度健全，管理科学。
冷库要实行科学堆垛，合理利用库容。库内肉品堆垛符合冷库管理规范要求，做到“三离两挂两留”（三离：码垛离墙、离地、离排管；两挂：每垛挂牌，库内挂温度计；两留：留过道，留操作空间）。每垛均须挂牌（规格为长35cm，20cm），注明片（箱）数、重量、品种、等级、生产厂家、加工日期、入库时间。
储备库须做到库温稳定，必须保持在－18℃以下。在正常情况下，一昼夜温度升降幅度不超过1℃，在肉品进出库过程中，库温升温幅度不得超过4℃。
国家储备肉出库（更新），必须服从国内贸易部统一安排。国家储备肉定点储备库接到国内贸易部出库（更新）通知单后，具体实施。
四、质量管理
国家储备肉定点生产厂，所生产的冻白条肉质量须符合GB9959.1－88〔带皮鲜、冻片猪肉〕国家标准（增加不带板油）；分割冻猪瘦肉须符合GB9959.4－88〔分割冻猪瘦肉〕国家标准二级。
加工厂质量检验机构完善，实行主任兽医师质量负责制，并有与生产规模相适应有一定数量的、获得卫检师合格证的卫检人员。
应检工序齐全，检验方法应当符合农业部、卫生部、外贸部、商业部的《肉品卫生检验试行规程》和其他有关规定，规格分级正确。
加工厂应当具备与生产品种、规模相适应的检验设施，完善的仪器设备；旋毛虫检验和肉品化验室设备要符合有关规定。
肉品检验后，应当按《肉品卫生检验试行规程》中有关规定处理产品，并有相应处理设施和监督检查制度。
检验人员要符合《兽医卫生技术（检疫、检验、化验）业务技术等级标准》规定的三级以上标准。
承担国家储备肉任务的冷库，必须设专职的卫检人员对入库的商品进行严格的验收，查验随车检疫证明，查验车内卫生及肉表卫生，测试车内温度和肉品温度。肉品中心温度高于－8℃时不得直接进入冷藏库。
