(1)幼苗期①子叶展开期。在子叶出土以后、真叶展开之前，正常的幼苗形态是两片子叶肥厚，下胚轴距离地面3厘米左右。子叶瘦小、细长是由光照不足或夜间温度偏高、水分供应过度引起的。子叶瘦小、下胚轴很短是因为温度低、床土的透气性差，也可能是因为水分供应不足。
②花芽分化期。2片子叶完全展开，第3片真叶正在展开时，是辣椒的花芽开始分化期，同时开始分枝，一般为双权分枝。在夜间温度低、昼夜温差较大，且营养条件良好时，易出现三权分枝。
③成苗的形态表现。已经育成的辣椒幼苗，一般9-14片叶，已经显蕾，株高18-25厘米，子叶完好，真叶厚实而有光泽，带大花蕾，根系颜色为鲜亮的白色，在营养钵内不盘根。根须少、茎细长、子叶脱落、叶片大而薄、颜色淡绿、叶柄较长是苗徒长的表现，这种苗定植后缓苗慢、发棵晚、苗弱，易受病虫的侵染，易落花落果。
(2)结果期：生长发育正常的辣椒植株，结果部位距顶梢约25厘米，开花处距顶梢约10厘米，其间有1-2个较大的花蕾，开花节至结果节有3片已经充分展开的叶片，节间长4-5厘米。氮、磷肥良好时，叶片呈尖端较长的三角形；钾肥充足时，叶片呈宽幅的圆形。花为长柱花，长柱花授粉良好，果实发育快，可长成肥大的果实。下面是各器官的生理病害表现。
①花。开花节位到顶梢的距离超过15厘米，枝条直，节间较长，次级分枝粗，花小而且质量差，这是植株徒长的表现。这是由氮肥和水分充足、夜间温度高、光照弱造成的，栽培的密度过大也会引起植株徒长。出现中柱花和短柱花，说明环境条件差，植株营养不良。可摘除长势弱的侧枝，使养分集中供应，调整营养生长与生殖生长的平衡，从而减少中、短柱花。
②茎。生长迟缓，节间短，节部弯曲，次级分枝小且短，开花节位距顶梢仅2-3厘米，这样的植株使生长受到了抑制。主要是因为夜间温度低，特别是土壤温度低，或土壤板结、通气不良、含氧量少使根系发育受到抑制。结果过多也会出现此种情况。
③叶。顶部幼叶出现凹凸，叶片皱缩，是氮肥施用过多造成的。植株中部的叶片中肋突出，植株下部的叶片扭曲，叶片大，叶柄长，这也是氮肥多的表现。受冷害时，叶片上翘，向上反卷。受冻害时，叶片首先出现像开水烫过一样的症状，继而出现失水状，最后萎蔫干枯。
土壤水分多时，叶柄撑开，叶片下垂。在高湿的条件下根系衰弱，地上部的养分和生长素不能运输到根，而积累在根茎以上的部位，所以叶柄偏上生长而叶片下垂。施肥不当会造成肥害，追施磷酸二铵过量或方法不当，则叶片的主侧脉基部呈辐射状地出现生理性失水，进而黄化。追施尿素的方法不当，则会在叶片上出现点状或不规则状的生理性失水，进而黄化。缺氮时，植株瘦小，叶绿体形成受阻，叶片颜色由浓绿转成淡绿至黄绿，叶柄、叶基部红色，下部叶片黄化。茶黄螨的危害、光照不足同样可引起叶片黄化。磷肥不足时，叶片呈暗绿色，有褐斑，老叶变成褐色，叶片的厚度小于正常叶，叶片有时畸形。钾肥不足时，叶片出现斑状的缺绿症状，叶缘和叶尖坏死，叶片小，卷曲皱缩，茎的节间短。土壤ph高，使植株吸收铁困难，造成植株缺铁，叶片变为白色或黄白色，而且嫩叶先出现。缺镁时，植株表现出特殊的缺绿症状，先端变黄，颜色转变突然，从叶片的中心开始有黄斑，落叶早。缺铜时，叶绿素合成少，叶尖发白。菊酯类的药物应用不当时，在叶片上出现点状或不规则的黄化斑，不受叶的限制。有机磷类药物的使用浓度不当时，嫩叶、新叶变小，向上翻卷，叶肉增厚，叶脉凸起，叶缘有时出现缺刻，叶色发暗。激素或除草剂类的药物应用不当时，辣椒的嫩叶、新叶扭陷变形，细小，但叶色基本正常。以上这些药害出现以后，可用400倍的白糖和400倍的尿素混合液喷辣椒植株，7天1次，连喷2-3次。
④果实。白天日照不良、夜间温度低、土壤干燥或栽培密度过大会形成小果、种子少，有时还会形成浆果。果实短是因为土壤干燥或土壤浓度过高影响了根系的吸收机能。果实表面无光泽的原因是高温干旱。
