孕初期有褐色血栓物可能是受精卵着床出血、先兆流产、阴道炎等原因，需要根据具体情况对症治疗。
1、受精卵着床出血
着床是指胚泡通过与子宫内膜相互作用，侵入子宫内膜的过程。一般认为着床开始于受精后的第6天到第7天，至第11天到第12天完成。而着床出血则是指着床过程中出现的出血。孕初期有褐色血栓物可能是着床出血，少部分人孕初期会出现着床出血，出血量较少，通常不会影响胎儿的生长发育以及母体的健康情况，症状可自行消失，通常无需进行特殊的治疗。
2、先兆流产
先兆流产是指妊娠28周前出现少量阴道流血，继而出现阵发性下腹痛或腰背痛等症状，也可能会出现孕初期有褐色血栓物的情况。导致先兆流产的原因有很多，通常与胎儿因素、母体因素、环境因素、父亲因素等有关。先兆流产患者可采用卧床休息、药物治疗等积极保胎的措施，若症状消失，可以继续妊娠。对于黄体功能不足的患者，可遵医嘱通过肌肉注射或口服黄体酮用以保胎，也可使用阴道用黄体酮，如黄体酮缓释凝胶。保胎治疗后如果病情不断进展，应及时终止妊娠，进行清宫术或者刮宫术，尽可能使妊娠物完全排出。
3、阴道炎
阴道炎是因各种原因导致的阴道炎症，患者主要表现为阴道分泌物异常，阴道出现瘙痒、疼痛、灼热感等症状，可伴有褐色血栓物的情况。阴道炎的发生原因与细菌感染、真菌感染、寄生虫感染、雌激素水平下降、发育不完善、不良刺激等有关。如果是外阴阴道假丝酵母菌病，妊娠期患者应以局部用药为主，以小剂量长疗程为佳，禁用口服唑类抗真菌药物。患者可以在医生的指导下使用克霉唑阴道片、制霉菌素阴道泡腾片等进行阴道塞药治疗。
孕初期饮食上要保持清淡，还要避免同房，此时处于最不稳定的阶段，以免导致流产的现象。同时还应注意及时补充叶酸，预防胎儿畸形。
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